Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KIAA0408Q6ZU52 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA0408Q6ZU52 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA0408Q6ZU52 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA0408Q6ZU52 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA0408Q6ZU52 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA0408Q6ZU52 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA0408Q6ZU52 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA0408Q6ZU52 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA0408Q6ZU52 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA0408Q6ZU52 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA0408Q6ZU52 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA0408Q6ZU52 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA0408Q6ZU52 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA0408Q6ZU52 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms