Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT89

SLC25A48, Solute carrier family 25 member 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A48Q6ZT89 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A48Q6ZT89 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms