Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LIAT1Q6ZQX7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms