Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP4Q6PIL6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms