Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LMOD2Q6P5Q4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMOD2Q6P5Q4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LMOD2Q6P5Q4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD2Q6P5Q4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms