Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC41PQ6P2S7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms