Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC42EP5Q6NZY7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms