Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms