Protein–RNA interactions for Protein: Q6H8Q1

ABLIM2, Actin-binding LIM protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM2Q6H8Q1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABLIM2Q6H8Q1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms