Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms