Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRCH2Q5VUJ6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms