Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEF1A1P5Q5VTE0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms