Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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