Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPRD2Q5VT52 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPRD2Q5VT52 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms