Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYT6Q5T7P8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms