Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CEP170Q5SW79 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
CEP170Q5SW79 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CEP170Q5SW79 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms