Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms