Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms