Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR44Q5JSH3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR44Q5JSH3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms