Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTBL2Q562R1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms