Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms