Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC92Q53HC0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms