Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL22Q53GT1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms