Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
C4orf46Q504U0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms