Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UVSSAQ2YD98 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UVSSAQ2YD98 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms