Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC6LQ2NKX8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms