Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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