Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PFKFB3Q16875 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFKFB3Q16875 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms