Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHQ16836 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHQ16836 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHQ16836 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHQ16836 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHQ16836 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHQ16836 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HADHQ16836 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HADHQ16836 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HADHQ16836 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HADHQ16836 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HADHQ16836 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HADHQ16836 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HADHQ16836 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HADHQ16836 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HADHQ16836 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HADHQ16836 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HADHQ16836 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HADHQ16836 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HADHQ16836 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HADHQ16836 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HADHQ16836 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HADHQ16836 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HADHQ16836 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HADHQ16836 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HADHQ16836 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HADHQ16836 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HADHQ16836 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HADHQ16836 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HADHQ16836 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HADHQ16836 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HADHQ16836 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HADHQ16836 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HADHQ16836 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HADHQ16836 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HADHQ16836 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HADHQ16836 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HADHQ16836 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HADHQ16836 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HADHQ16836 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HADHQ16836 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HADHQ16836 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HADHQ16836 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HADHQ16836 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HADHQ16836 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HADHQ16836 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HADHQ16836 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HADHQ16836 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HADHQ16836 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HADHQ16836 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HADHQ16836 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HADHQ16836 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HADHQ16836 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HADHQ16836 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HADHQ16836 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HADHQ16836 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HADHQ16836 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HADHQ16836 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HADHQ16836 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HADHQ16836 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HADHQ16836 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HADHQ16836 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HADHQ16836 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HADHQ16836 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HADHQ16836 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HADHQ16836 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HADHQ16836 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HADHQ16836 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HADHQ16836 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HADHQ16836 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HADHQ16836 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HADHQ16836 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HADHQ16836 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HADHQ16836 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HADHQ16836 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HADHQ16836 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HADHQ16836 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HADHQ16836 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HADHQ16836 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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