Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCK2Q16822 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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