Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD1Q16676 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
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FOXD1Q16676 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
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FOXD1Q16676 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
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FOXD1Q16676 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
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