Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STX1AQ16623 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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