Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
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