Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF56Q15929 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms