Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
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