Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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