Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USF2Q15853 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USF2Q15853 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USF2Q15853 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
USF2Q15853 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
USF2Q15853 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
USF2Q15853 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USF2Q15853 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USF2Q15853 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USF2Q15853 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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