Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPTX1Q15818 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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