Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms