Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SF1Q15637 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SF1Q15637 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SF1Q15637 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SF1Q15637 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SF1Q15637 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SF1Q15637 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SF1Q15637 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SF1Q15637 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SF1Q15637 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SF1Q15637 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SF1Q15637 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SF1Q15637 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SF1Q15637 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SF1Q15637 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SF1Q15637 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SF1Q15637 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SF1Q15637 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SF1Q15637 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SF1Q15637 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SF1Q15637 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SF1Q15637 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SF1Q15637 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SF1Q15637 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SF1Q15637 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SF1Q15637 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.74
SF1Q15637 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SF1Q15637 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SF1Q15637 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SF1Q15637 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SF1Q15637 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SF1Q15637 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SF1Q15637 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SF1Q15637 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SF1Q15637 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SF1Q15637 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SF1Q15637 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SF1Q15637 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SF1Q15637 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SF1Q15637 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SF1Q15637 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SF1Q15637 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SF1Q15637 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SF1Q15637 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SF1Q15637 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SF1Q15637 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SF1Q15637 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SF1Q15637 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SF1Q15637 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SF1Q15637 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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