Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms