Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAPTM4AQ15012 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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