Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPNMBQ14956 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPNMBQ14956 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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