Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIXQ14938 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIXQ14938 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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