Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL4A6Q14031 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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COL4A6Q14031 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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