Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC3Q14003 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNC3Q14003 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNC3Q14003 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNC3Q14003 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.33■■□□□ 1
KCNC3Q14003 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNC3Q14003 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KCNC3Q14003 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KCNC3Q14003 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC3Q14003 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC3Q14003 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC3Q14003 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC3Q14003 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KCNC3Q14003 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC3Q14003 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC3Q14003 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC3Q14003 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC3Q14003 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KCNC3Q14003 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC3Q14003 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC3Q14003 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC3Q14003 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC3Q14003 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC3Q14003 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC3Q14003 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC3Q14003 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC3Q14003 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC3Q14003 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC3Q14003 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC3Q14003 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC3Q14003 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC3Q14003 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC3Q14003 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC3Q14003 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC3Q14003 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC3Q14003 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC3Q14003 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCNC3Q14003 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC3Q14003 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC3Q14003 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC3Q14003 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC3Q14003 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC3Q14003 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC3Q14003 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC3Q14003 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC3Q14003 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNC3Q14003 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC3Q14003 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC3Q14003 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms