Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF5Q13568 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms