Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPA4Q13156 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms