Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 CLPTM1L-203ENST00000503151 627 ntTSL 313.62□□□□□ -0.236e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 CLPTM1L-210ENST00000508765 631 ntTSL 313.07□□□□□ -0.326e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 CLPTM1L-202ENST00000503042 3540 ntTSL 210.4□□□□□ -0.746e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.83e-7■■■■□ 23.8
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TARDBPQ13148 RPL11-205ENST00000482370 879 ntTSL 1 (best)8.83□□□□□ -12e-8■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 RPL11-201ENST00000374550 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.012e-8■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 SRP68-211ENST00000592704 1941 ntTSL 224.76■■□□□ 1.554e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.24e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.964e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.57e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 DTL-206ENST00000542077 4471 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.967e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 DTL-203ENST00000475419 3662 ntTSL 25.53□□□□□ -1.527e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.095e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.195e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 ORC1-201ENST00000371566 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 ORC1-202ENST00000371568 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 23.8
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TARDBPQ13148 CENPO-209ENST00000498362 761 ntTSL 515.52■□□□□ 0.081e-6■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.141e-6■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 CENPO-208ENST00000491031 1579 ntTSL 212.65□□□□□ -0.381e-6■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 CENPO-206ENST00000473706 4272 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.571e-6■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 CENPO-201ENST00000260662 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.711e-6■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 CENPO-205ENST00000473476 459 ntTSL 45.45□□□□□ -1.541e-6■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 SH3GL3-205ENST00000563901 1647 ntTSL 1 (best)25.76■■□□□ 1.713e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.543e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 SH3GL3-201ENST00000324537 2012 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.983e-7■■■■□ 23.8
TARDBPQ13148 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -04e-7■■■■□ 23.7
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TARDBPQ13148 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.111e-6■■■■□ 23.7
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TARDBPQ13148 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.21e-6■■■■□ 23.7
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TARDBPQ13148 SLC38A6-204ENST00000491344 2501 ntTSL 1 (best)7.94□□□□□ -1.143e-7■■■■□ 23.7
TARDBPQ13148 FN3KRP-208ENST00000576363 666 ntTSL 1 (best)15.14■□□□□ 0.011e-6■■■■□ 23.7
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TARDBPQ13148 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.369e-7■■■■□ 23.7
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TARDBPQ13148 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.771e-6■■■■□ 23.7
TARDBPQ13148 EML2-205ENST00000586195 1952 ntTSL 219.57■□□□□ 0.721e-6■■■■□ 23.7
TARDBPQ13148 EML2-208ENST00000586902 557 ntTSL 419.45■□□□□ 0.71e-6■■■■□ 23.7
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TARDBPQ13148 PRRC2C-203ENST00000392078 1919 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.979e-7■■■■□ 23.7
TARDBPQ13148 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.149e-7■■■■□ 23.7
TARDBPQ13148 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.359e-7■■■■□ 23.7
TARDBPQ13148 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -03e-7■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.053e-7■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.894e-7■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.814e-7■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.44e-7■■■■□ 23.6
TARDBPQ13148 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.264e-7■■■■□ 23.6
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TARDBPQ13148 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.034e-7■■■■□ 23.6
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TARDBPQ13148 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.414e-7■■■■□ 23.6
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TARDBPQ13148 YY1AP1-209ENST00000368330 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.724e-7■■■■□ 23.6
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TARDBPQ13148 YY1AP1-215ENST00000436865 2684 ntTSL 1 (best)8.52□□□□□ -1.054e-7■■■■□ 23.6
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