Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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MRPL28Q13084 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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MRPL28Q13084 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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MRPL28Q13084 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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MRPL28Q13084 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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MRPL28Q13084 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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